黄芩主要含小檗碱、黄连素、甲基黄连碱等多种生物碱。对痢疾杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌有抑制作用。
抑菌实验证明，蒸、煮过的黄芩对白喉村菌、绿脓杆菌、溶血性链球菌、大肠杆菌等的抑制作用比生黄芩（原生药）、冷水当黄芩强。这是因为黄芩经蒸制或沸水煮后，可使酶灭活，不致酶解黄芩甘类成分，从而保存药效。

黄芩味苦、性寒，归肺、心、胆、肝、胃、大肠经；
体轻气清，可升可降；具有清热燥湿，泻火解毒，止血，安胎的功效；
主治湿热内蕴，呕吐，泻痢，黄疸，热淋，肺热咳嗽咯痰，温病发热烦渴，肝火头痛目赤，痈肿疔疮，吐衄便血，崩漏下血，胎热不安。

根据炮制方法的不同分为黄芩、炒黄芩、黄芩炭、姜黄芩、酒黄芩。炮制后贮干燥容器内，姜黄芩、酒黄芩密闭，置阴凉干燥处，防潮。